- 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6下载软件包wget https://master.dl.sourceforge.net/project/bowtie-bio/bowtie2/2.4.5/bowtie2-2.4.5-linux-aarc... 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6下载软件包wget https://master.dl.sourceforge.net/project/bowtie-bio/bowtie2/2.4.5/bowtie2-2.4.5-linux-aarc...
- 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6安装依赖yum install -y git autoconf下载软件wget http://ccb.jhu.edu/software/stringtie/dl/stringtie-2.2.0.tar.... 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6安装依赖yum install -y git autoconf下载软件wget http://ccb.jhu.edu/software/stringtie/dl/stringtie-2.2.0.tar....
- 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6安装系统依赖yum install -y python-devel安装cutadaptpip install cutadapt验证3. 验证 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6安装系统依赖yum install -y python-devel安装cutadaptpip install cutadapt验证3. 验证
- 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6安装系统依赖yum install expat-devel perl-CPAN gd gd-devel.aarch64 -y安装perl模块cpan App::cpanminuscpanm --mirr... 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6安装系统依赖yum install expat-devel perl-CPAN gd gd-devel.aarch64 -y安装perl模块cpan App::cpanminuscpanm --mirr...
- 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6前提条件,安装好R语言环境安装R包依赖,进入R控制台install.pakages(“pbapply”)install.packages("squash")install.packages("iotoo... 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6前提条件,安装好R语言环境安装R包依赖,进入R控制台install.pakages(“pbapply”)install.packages("squash")install.packages("iotoo...
- 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6前提条件,安装好R语言环境安装依赖libgit21.2 下载软件包wget https://github.com/libgit2/libgit2/archive/main.zip -O libgit2-... 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6前提条件,安装好R语言环境安装依赖libgit21.2 下载软件包wget https://github.com/libgit2/libgit2/archive/main.zip -O libgit2-...
- 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6系统依赖安装yum install libconfig libconfig-devel python3-devel cmake3 -y1.1 如果系统pagesize修改为4k,需要源码安装libcon... 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6系统依赖安装yum install libconfig libconfig-devel python3-devel cmake3 -y1.1 如果系统pagesize修改为4k,需要源码安装libcon...
- 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统Kylin Linux Advanced Server V10 (Tercel)执行安装,在rstudio或R会话终端中执行BiocManager::install("GSVA")验证结果导入包Library(“GSVA”... 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统Kylin Linux Advanced Server V10 (Tercel)执行安装,在rstudio或R会话终端中执行BiocManager::install("GSVA")验证结果导入包Library(“GSVA”...
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- 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统Kylin Linux Advanced Server V10 (Tercel)安装依赖yum install -y git-lfs下载源码包git clone https://github.com/broadinstit... 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统Kylin Linux Advanced Server V10 (Tercel)安装依赖yum install -y git-lfs下载源码包git clone https://github.com/broadinstit...
- 华大基因和华为云将继续为基因乃至泛医疗行业的发展带来更多想象空间。 华大基因和华为云将继续为基因乃至泛医疗行业的发展带来更多想象空间。
- 上华为云,不仅是简单的时间和成本节省,更是使各类患者享受到科技带来的帮助。 上华为云,不仅是简单的时间和成本节省,更是使各类患者享受到科技带来的帮助。
- 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网(可以访问谷歌)操作系统Kylin Linux Advanced Server V10 (Tercel)安装rstudio需要优先准备R语言环境,R语言环境准备请参考,推荐安装4.1+版本:https://ic-openlabs.... 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网(可以访问谷歌)操作系统Kylin Linux Advanced Server V10 (Tercel)安装rstudio需要优先准备R语言环境,R语言环境准备请参考,推荐安装4.1+版本:https://ic-openlabs....
- 全基因组甲基化测序(WGBS)是一种研究DNA甲基化的方法,以全面了解在基因组水平上的表观遗传变化。在进行WGBS数据分析时,通常需要使用专门的比对工具,因为这些工具需要能够处理亚硫酸盐转化后的数据。以下是四个不同的WGBS比对分析流程:Bismark:Bismark是一个基于Bowtie2或HISAT2比对器的流行WGBS分析工具。它允许处理双链亚硫酸盐转化测序数据,并提供甲基化位点的检测... 全基因组甲基化测序(WGBS)是一种研究DNA甲基化的方法,以全面了解在基因组水平上的表观遗传变化。在进行WGBS数据分析时,通常需要使用专门的比对工具,因为这些工具需要能够处理亚硫酸盐转化后的数据。以下是四个不同的WGBS比对分析流程:Bismark:Bismark是一个基于Bowtie2或HISAT2比对器的流行WGBS分析工具。它允许处理双链亚硫酸盐转化测序数据,并提供甲基化位点的检测...
- 开发背景Sentieon专业软件开发团队除了专注于高效基因组数据分析工具的研发,还与专业合作伙伴一起积极的参与到大型的临床科研项目中,其中就包括了美国国立卫生研究院NIH赞助的Gabriella Miller Kids First (GMKF) 项目。此项目落地于费城儿童医院数据中心,已经产生了来自于2万名患者的4.8万套全基因组数据,涉及了包括44种儿童癌症以及出生缺陷在内的多种疾病。除了... 开发背景Sentieon专业软件开发团队除了专注于高效基因组数据分析工具的研发,还与专业合作伙伴一起积极的参与到大型的临床科研项目中,其中就包括了美国国立卫生研究院NIH赞助的Gabriella Miller Kids First (GMKF) 项目。此项目落地于费城儿童医院数据中心,已经产生了来自于2万名患者的4.8万套全基因组数据,涉及了包括44种儿童癌症以及出生缺陷在内的多种疾病。除了...
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