- 医疗智能体(EIHealth)基于华为云AI和大数据技术优势,为基因组分析、药物研发、临床研究三个领域提供专业AI研发平台。 医疗智能体(EIHealth)基于华为云AI和大数据技术优势,为基因组分析、药物研发、临床研究三个领域提供专业AI研发平台。
- 关键词:长读长测序;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Sentieon DNAscope LongRead – A highly Accurate, Fast, and Efficient Pipeline for Germline Variant Calling from PacBio HiFi reads标题(中文):Sentieon DNAscope LongRead - 从 ... 关键词:长读长测序;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Sentieon DNAscope LongRead – A highly Accurate, Fast, and Efficient Pipeline for Germline Variant Calling from PacBio HiFi reads标题(中文):Sentieon DNAscope LongRead - 从 ...
- 1 Micromamba 简介大家是否有这样的经历,使用conda/anaconda进行环境配置的是否速度非常慢,进度经常卡在“Collecting package metadata”上。甚至有时候需要安装的软件比较多,或者需要用到conda-forge这个最大的channel,conda能一直卡在collecting步骤上直到http连接超时也没能处理完毕。直到有天小编发现了mamba这... 1 Micromamba 简介大家是否有这样的经历,使用conda/anaconda进行环境配置的是否速度非常慢,进度经常卡在“Collecting package metadata”上。甚至有时候需要安装的软件比较多,或者需要用到conda-forge这个最大的channel,conda能一直卡在collecting步骤上直到http连接超时也没能处理完毕。直到有天小编发现了mamba这...
- 关键词:长读长测序;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Chromosome-Level Genome Assembly of the Green Peafowl (Pavo muticus)标题(中文):绿孔雀(Pavo muticus)的染色体级基因组组装发表期刊:Genome Biology and Evolution作者单位:东北林业大学等发表年份:2022文章地址:https... 关键词:长读长测序;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Chromosome-Level Genome Assembly of the Green Peafowl (Pavo muticus)标题(中文):绿孔雀(Pavo muticus)的染色体级基因组组装发表期刊:Genome Biology and Evolution作者单位:东北林业大学等发表年份:2022文章地址:https...
- 关键词:流行病学;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Profiling SARS-CoV-2 mutation fingerprints that range from the viral pangenome to individual infection quasispecies标题(中文):剖析从病毒泛基因组到单个感染类群的 SARS-CoV-2 变异指纹图谱发表期刊:Genom... 关键词:流行病学;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Profiling SARS-CoV-2 mutation fingerprints that range from the viral pangenome to individual infection quasispecies标题(中文):剖析从病毒泛基因组到单个感染类群的 SARS-CoV-2 变异指纹图谱发表期刊:Genom...
- 研究展示了从无症状到危重症的大量 COVID-19 患者中血液样本的跨组学景观,提供了与COVID-19相关的新见解和治疗靶点,以及破译COVID-19及其潜在机制的宝贵线索。 研究展示了从无症状到危重症的大量 COVID-19 患者中血液样本的跨组学景观,提供了与COVID-19相关的新见解和治疗靶点,以及破译COVID-19及其潜在机制的宝贵线索。
- CNVscope是Sentieon推出的一款基于机器学习的全基因组CNV分析检测模块。该模块主要用于检测大于5kb的拷贝数增加或缺失,方法是通过分析reads的深度信息,并结合断点检测等其他特征进行拷贝数判断。 CNVscope是Sentieon推出的一款基于机器学习的全基因组CNV分析检测模块。该模块主要用于检测大于5kb的拷贝数增加或缺失,方法是通过分析reads的深度信息,并结合断点检测等其他特征进行拷贝数判断。
- 1、准备工作:License下载链接:http://www.sentieon.com/eula/b703e839c8c7c5b8fa73238277fd5da23a0276be54712edb46ee8f4d4f3d873fbf软件下载地址:https://insvast-download.oss-cn-shanghai.aliyuncs.com/Sentieon/release/sent... 1、准备工作:License下载链接:http://www.sentieon.com/eula/b703e839c8c7c5b8fa73238277fd5da23a0276be54712edb46ee8f4d4f3d873fbf软件下载地址:https://insvast-download.oss-cn-shanghai.aliyuncs.com/Sentieon/release/sent...
- 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6背景:cellranger因源码只开源到3.0.2版本,且3.0.2版本在跑cellranger count基因分析结果出图表报告使用到tsne算法,cellranger官网提供的cellranger二... 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统CentOS 7.6背景:cellranger因源码只开源到3.0.2版本,且3.0.2版本在跑cellranger count基因分析结果出图表报告使用到tsne算法,cellranger官网提供的cellranger二...
- 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统Kylin Linux Advanced Server V10 (Tercel)安装monocle(推荐使用新包monocle3)devtools::install_github("cole-trapnell-lab/mo... 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网操作系统Kylin Linux Advanced Server V10 (Tercel)安装monocle(推荐使用新包monocle3)devtools::install_github("cole-trapnell-lab/mo...
- 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网下载源码到本地服务器wget https://github.com/lh3/bwa/archive/refs/tags/v0.7.17.tar.gz -o bwa-0.7.17.tar.gz解压软件包tar –xf bwa-0.7... 项目说明服务器TaiShan 200服务器(型号2280)CPU鲲鹏920 5250处理器内存无要求存储无要求磁盘分区/top空间建议保留100G+网络能访问互联网下载源码到本地服务器wget https://github.com/lh3/bwa/archive/refs/tags/v0.7.17.tar.gz -o bwa-0.7.17.tar.gz解压软件包tar –xf bwa-0.7...
- 云原生基础设施来帮忙,农作物基因测序不再难 云原生基础设施来帮忙,农作物基因测序不再难
- kentUtils是与UCSC基因组浏览器结合使用的一系列生物信息学实用程序。1 安装准备华为云购买一台鲲鹏服务器本文以云服务器KC1实例搭建,云服务器配置如表1-1所示。 表1-1 云服务器配置项目说明规格kc1.large.2 | 2vCPUs | 4GB磁盘系统盘:高IO(40GB) 表1-2 CentOS操作系统要求项目说明下载地址CentOS7.6在公共镜像中已提供。K... kentUtils是与UCSC基因组浏览器结合使用的一系列生物信息学实用程序。1 安装准备华为云购买一台鲲鹏服务器本文以云服务器KC1实例搭建,云服务器配置如表1-1所示。 表1-1 云服务器配置项目说明规格kc1.large.2 | 2vCPUs | 4GB磁盘系统盘:高IO(40GB) 表1-2 CentOS操作系统要求项目说明下载地址CentOS7.6在公共镜像中已提供。K...
- vcftools是一种可以对VCF文件和BCF文件进行格式转换及过滤的工具,其中很多过滤及计算功能可以自己使用perl或者python编写脚本实现,但都不如这个工具的运算速度快。本文档以“vcftools-0.1.16”为例进行说明1 安装准备华为云购买一台鲲鹏服务器本文以云服务器KC1实例搭建,云服务器配置如表1-1所示。表1-1 云服务器配置项目说明规格kc1.large.2... vcftools是一种可以对VCF文件和BCF文件进行格式转换及过滤的工具,其中很多过滤及计算功能可以自己使用perl或者python编写脚本实现,但都不如这个工具的运算速度快。本文档以“vcftools-0.1.16”为例进行说明1 安装准备华为云购买一台鲲鹏服务器本文以云服务器KC1实例搭建,云服务器配置如表1-1所示。表1-1 云服务器配置项目说明规格kc1.large.2...
- 1 介绍 PennCNV是一个免费软件工具,可从SNP基因分型阵列检测拷贝数变异(CNV)。目前,它可以处理来自Illumina和Affymetrix阵列的信号强度数据。通过适当准备文件格式,它还可以处理其他类型的SNP阵列和寡核苷酸阵列。PennCNV实现了一个隐藏的马尔可夫模型(HMM),该模型集成了多种信息源,以推断单个基因型样本的CNV调用。官网为:http://p... 1 介绍 PennCNV是一个免费软件工具,可从SNP基因分型阵列检测拷贝数变异(CNV)。目前,它可以处理来自Illumina和Affymetrix阵列的信号强度数据。通过适当准备文件格式,它还可以处理其他类型的SNP阵列和寡核苷酸阵列。PennCNV实现了一个隐藏的马尔可夫模型(HMM),该模型集成了多种信息源,以推断单个基因型样本的CNV调用。官网为:http://p...
上滑加载中
推荐直播
-
让你的应用用上GaussDB
2024/12/19 周四 16:30-18:00
Jerry 华为云生态技术讲师
GaussDB很受客户关注,伙伴们想知道什么时候该选用,开发者也跃跃欲试想尝鲜。课程会分享适用的场景,并一步步演示如何用上GaussDB。
即将直播 -
2024创原会年度技术峰会
2024/12/20 周五 09:00-12:00
华为云讲师团
2024创原会年度技术峰会将于12月20日在海南万宁石梅湾威斯汀酒店举办,本次大会将以“智能・进化”为主题探讨从Cloud Native到AI Native的新阶段企业如何通过AI技术重塑企业应用,围绕AI如何在千行万业落地进行深入交流,探索可以先行先试先成功的创新场景和实现路径。
即将直播 -
华为云开发者日·2024年度创享峰会
2024/12/23 周一 14:00-16:00
华为云讲师团
华为云开发者日HDC.Cloud Day是面向全球开发者的旗舰活动,汇聚来自千行百业、高校及科研院所的开发人员。致力于打造开发者专属的技术盛宴,全方位服务与赋能开发者围绕华为云生态“知、学、用、创、商”的成长路径。通过前沿的技术分享、场景化的动手体验、优秀的应用创新推介,为开发者提供沉浸式学习与交流平台。开放创新,与开发者共创、共享、共赢未来。
去报名
热门标签