- 关键词:液体活检;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Serial circulating tumor DNA to predict early recurrence in patients with hepatocellular carcinoma: a prospective study标题(中文):连续循环肿瘤DNA检测可预测肝癌患者早期复发:一项前瞻性研究发表期刊:Molecu... 关键词:液体活检;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Serial circulating tumor DNA to predict early recurrence in patients with hepatocellular carcinoma: a prospective study标题(中文):连续循环肿瘤DNA检测可预测肝癌患者早期复发:一项前瞻性研究发表期刊:Molecu...
- 作者:石公星,雨润集团基础数据平台架构师导读:数字化转型的浪潮中,高效准确的数据分析能够帮助雨润集团快速洞察市场动态、优化供应链管理、提高生产效率。雨润集团引入了 Apache Doris 构建了统一实时数据仓库,实现了计算效率提升 30 倍、存储资源节省 90%、成本降低超 100 万、人员效率提升 3 倍,为智能化、高效化转型指明了方向。雨润控股集团是一家集食品、地产、商业、物流、旅游、... 作者:石公星,雨润集团基础数据平台架构师导读:数字化转型的浪潮中,高效准确的数据分析能够帮助雨润集团快速洞察市场动态、优化供应链管理、提高生产效率。雨润集团引入了 Apache Doris 构建了统一实时数据仓库,实现了计算效率提升 30 倍、存储资源节省 90%、成本降低超 100 万、人员效率提升 3 倍,为智能化、高效化转型指明了方向。雨润控股集团是一家集食品、地产、商业、物流、旅游、...
- 介绍本文介绍了使用Sentieon®工具处理下一代测序数据的方法,同时利用分子条码信息(也称为唯一分子索引或UMI)。分子条码可以在测序之前在模板DNA分子的末端引入唯一标签,从而大大减少PCR重复和测序错误对变异调用过程的影响。Sentieon®工具提供从读数据中提取UMI标签和执行基于条码的一致性生成的功能。此流程预期输入是无适配器的条形码化读取数据。UMI一致性流程的输出是一个包含从条... 介绍本文介绍了使用Sentieon®工具处理下一代测序数据的方法,同时利用分子条码信息(也称为唯一分子索引或UMI)。分子条码可以在测序之前在模板DNA分子的末端引入唯一标签,从而大大减少PCR重复和测序错误对变异调用过程的影响。Sentieon®工具提供从读数据中提取UMI标签和执行基于条码的一致性生成的功能。此流程预期输入是无适配器的条形码化读取数据。UMI一致性流程的输出是一个包含从条...
- 介绍本文档描述了如何利用Sentieon®基因组学工具的分片能力将DNAseq®流程分布到多台服务器上;将其他流程(如TNseq®)进行分布遵循相同原则,因为所有Sentieon®基因组学工具都具有相同的内置分布式处理能力。这种分布的目标是为了减少流程的总运行时间,以更快地生成结果;然而,这种分布也会带来一些额外的开销,使计算成本增加。 利用分布能力,流程的每个阶段被分成小任务;每个任务处理... 介绍本文档描述了如何利用Sentieon®基因组学工具的分片能力将DNAseq®流程分布到多台服务器上;将其他流程(如TNseq®)进行分布遵循相同原则,因为所有Sentieon®基因组学工具都具有相同的内置分布式处理能力。这种分布的目标是为了减少流程的总运行时间,以更快地生成结果;然而,这种分布也会带来一些额外的开销,使计算成本增加。 利用分布能力,流程的每个阶段被分成小任务;每个任务处理...
- cfDNA的TFx评估和拷贝数分析可以作为评估HCC患者TACE治疗结果的稳健策略。cfDNA中的某些拷贝数扩增会影响脂碘沉积并进一步影响TACE反应,这可用于更好地优化临床决策以指导个性化TACE治疗。 cfDNA的TFx评估和拷贝数分析可以作为评估HCC患者TACE治疗结果的稳健策略。cfDNA中的某些拷贝数扩增会影响脂碘沉积并进一步影响TACE反应,这可用于更好地优化临床决策以指导个性化TACE治疗。
- 从测试结果来看,相同核心数下,Arm架构CPU的运算效率不逊于支持超线程的x86架构CPU,并且倚天CPU的运行时长最短。此外,在高核心数(128)的运算环境下,流程的运行效率也基本没有损失,这点也得到了证实。倚天CPU实例的另一个优势是功耗较低,因此云计算成本也相对较低。 从测试结果来看,相同核心数下,Arm架构CPU的运算效率不逊于支持超线程的x86架构CPU,并且倚天CPU的运行时长最短。此外,在高核心数(128)的运算环境下,流程的运行效率也基本没有损失,这点也得到了证实。倚天CPU实例的另一个优势是功耗较低,因此云计算成本也相对较低。
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- 该研究通过对不同测序平台测序数据及不同生信分析流程的比较,总结了不同平台的数据特点并分析了相应的原因。 该研究通过对不同测序平台测序数据及不同生信分析流程的比较,总结了不同平台的数据特点并分析了相应的原因。
- 本次真相挑战凸显了在表征临床重要 MHC 位点方面、增加了基因组难比对区域的基准集、首次使用了盲法样本等诸多创新 本次真相挑战凸显了在表征临床重要 MHC 位点方面、增加了基因组难比对区域的基准集、首次使用了盲法样本等诸多创新
- 亲爱的社区小伙伴们,Apache Doris 2.0.12 版本已于 2024 年 6 月 27 日正式与大家见面,该版本提交了 99 个改进项以及问题修复,欢迎大家下载体验。官网下载: https://doris.apache.org/download/GitHub 下载: https://github.com/apache/doris/releases行为变更不再将建表的默认注释设置为表... 亲爱的社区小伙伴们,Apache Doris 2.0.12 版本已于 2024 年 6 月 27 日正式与大家见面,该版本提交了 99 个改进项以及问题修复,欢迎大家下载体验。官网下载: https://doris.apache.org/download/GitHub 下载: https://github.com/apache/doris/releases行为变更不再将建表的默认注释设置为表...
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