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- 摘要 人工神经网络的兴衰在计算机科学和计算化学的科学文献中都有详细记载。然而近二十年后,我们现在看到了对深度学习兴趣的复兴,这是一种基于多层神经网络的机器学习算法。在过去的几年里,我们看到了深度学习在许多领域的变革性影响,尤其是在语音识别和计算机视觉领域,在这些领域的大多数专家从业人员现在经常避开之前建立的有利于深度的模型学习模型。在这篇综述中,我们对深层神经网络理论... 摘要 人工神经网络的兴衰在计算机科学和计算化学的科学文献中都有详细记载。然而近二十年后,我们现在看到了对深度学习兴趣的复兴,这是一种基于多层神经网络的机器学习算法。在过去的几年里,我们看到了深度学习在许多领域的变革性影响,尤其是在语音识别和计算机视觉领域,在这些领域的大多数专家从业人员现在经常避开之前建立的有利于深度的模型学习模型。在这篇综述中,我们对深层神经网络理论...
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- 1. 研究背景 RNA与蛋白质之间的相互作用在转录后的调节中起重大作用,因此需对RNA-蛋白质(RBP)之间的结合进行预测,但是实验手段的应用难以广泛开展。结构生物学实验只能检测某一个特定RNA与蛋白间的相互作用,而不能提供统计意义上的结合偏好的信息。而assay的方法可以提供结合的亲和力,但是没有办法抓住具体的结构上的结合构象的差异和细... 1. 研究背景 RNA与蛋白质之间的相互作用在转录后的调节中起重大作用,因此需对RNA-蛋白质(RBP)之间的结合进行预测,但是实验手段的应用难以广泛开展。结构生物学实验只能检测某一个特定RNA与蛋白间的相互作用,而不能提供统计意义上的结合偏好的信息。而assay的方法可以提供结合的亲和力,但是没有办法抓住具体的结构上的结合构象的差异和细...
- 2019年12月,洛桑联邦理工学院和瑞士生物信息研究所的研究者在nature methods上提出使用分子表面的化学和几何指纹,来预测蛋白质和其他分子间的相互作用。 1 介绍 蛋白质与其他生物分子之间的相互作用是大多数生物过程中蛋白质功能的基础。仅从结构预测这些相互作用仍然是结构生物学中最重要的挑战之一。许多程序通过利用蛋白质序列和结构中的进化特征有效... 2019年12月,洛桑联邦理工学院和瑞士生物信息研究所的研究者在nature methods上提出使用分子表面的化学和几何指纹,来预测蛋白质和其他分子间的相互作用。 1 介绍 蛋白质与其他生物分子之间的相互作用是大多数生物过程中蛋白质功能的基础。仅从结构预测这些相互作用仍然是结构生物学中最重要的挑战之一。许多程序通过利用蛋白质序列和结构中的进化特征有效...
- 研究背景 组织病理学可以追溯到19世纪,它一直是病理学中使用的黄金标准诊断方法之一。如果在医学检查之后或在外科手术期间需要活组织检查,则需要从患者身上取出组织样本,然后将其切成微米薄片。这些病理学切片包含有关组织病理状态的微观信息;然而,这种薄的切片是透明的,并且在标准光学显微镜下不能提供足够的对比度。组织化学利用标本的... 研究背景 组织病理学可以追溯到19世纪,它一直是病理学中使用的黄金标准诊断方法之一。如果在医学检查之后或在外科手术期间需要活组织检查,则需要从患者身上取出组织样本,然后将其切成微米薄片。这些病理学切片包含有关组织病理状态的微观信息;然而,这种薄的切片是透明的,并且在标准光学显微镜下不能提供足够的对比度。组织化学利用标本的...
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