- 关键词:肿瘤测序;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Knockdown of NUSAP1 inhibits cell proliferation and invasion through downregulation of TOP2A in human glioblastoma标题(中文):敲减通过控制TOP2A下调的NUSAP1可以抑制人胶质母细胞瘤的细胞增殖和侵袭发表期刊:Ce... 关键词:肿瘤测序;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Knockdown of NUSAP1 inhibits cell proliferation and invasion through downregulation of TOP2A in human glioblastoma标题(中文):敲减通过控制TOP2A下调的NUSAP1可以抑制人胶质母细胞瘤的细胞增殖和侵袭发表期刊:Ce...
- 除了KCNH5变异体c.962G > A(p.S321N)患者有癫痫发作而无合并症外,KCNH5变异体相关癫痫患者均伴有ASD或精神运动发育迟缓。正如之前所报道的,KCNH5变异体c.980G > A(p.R327H)患者伴有癫痫发作和自闭症。 除了KCNH5变异体c.962G > A(p.S321N)患者有癫痫发作而无合并症外,KCNH5变异体相关癫痫患者均伴有ASD或精神运动发育迟缓。正如之前所报道的,KCNH5变异体c.980G > A(p.R327H)患者伴有癫痫发作和自闭症。
- 研究者构建了一种单倍型辅助贝叶斯方法用于鉴定胎儿基因型。该方法可能在NIPD检测由SNV和InDels引起的单基因病方面具有重要应用。 研究者构建了一种单倍型辅助贝叶斯方法用于鉴定胎儿基因型。该方法可能在NIPD检测由SNV和InDels引起的单基因病方面具有重要应用。
- 研究表明,在中国患者中,较高的新抗原负荷(NAL)可改善鳞状细胞肺癌(SCC)的无病生存期,但不能改善肺腺癌(ADC)的无病生存期。 研究表明,在中国患者中,较高的新抗原负荷(NAL)可改善鳞状细胞肺癌(SCC)的无病生存期,但不能改善肺腺癌(ADC)的无病生存期。
- 研究者使用piggyBac转座子系统构建了CAR T细胞,通过对两例淋巴细胞瘤恶性转化患者的研究,发现转基因并没有整合到已知的癌基因中。 研究者使用piggyBac转座子系统构建了CAR T细胞,通过对两例淋巴细胞瘤恶性转化患者的研究,发现转基因并没有整合到已知的癌基因中。
- 关键词:液体活检;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Serial circulating tumor DNA to predict early recurrence in patients with hepatocellular carcinoma: a prospective study标题(中文):连续循环肿瘤DNA检测可预测肝癌患者早期复发:一项前瞻性研究发表期刊:Molecu... 关键词:液体活检;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Serial circulating tumor DNA to predict early recurrence in patients with hepatocellular carcinoma: a prospective study标题(中文):连续循环肿瘤DNA检测可预测肝癌患者早期复发:一项前瞻性研究发表期刊:Molecu...
- 介绍本文介绍了使用Sentieon®工具处理下一代测序数据的方法,同时利用分子条码信息(也称为唯一分子索引或UMI)。分子条码可以在测序之前在模板DNA分子的末端引入唯一标签,从而大大减少PCR重复和测序错误对变异调用过程的影响。Sentieon®工具提供从读数据中提取UMI标签和执行基于条码的一致性生成的功能。此流程预期输入是无适配器的条形码化读取数据。UMI一致性流程的输出是一个包含从条... 介绍本文介绍了使用Sentieon®工具处理下一代测序数据的方法,同时利用分子条码信息(也称为唯一分子索引或UMI)。分子条码可以在测序之前在模板DNA分子的末端引入唯一标签,从而大大减少PCR重复和测序错误对变异调用过程的影响。Sentieon®工具提供从读数据中提取UMI标签和执行基于条码的一致性生成的功能。此流程预期输入是无适配器的条形码化读取数据。UMI一致性流程的输出是一个包含从条...
- 介绍本文档描述了如何利用Sentieon®基因组学工具的分片能力将DNAseq®流程分布到多台服务器上;将其他流程(如TNseq®)进行分布遵循相同原则,因为所有Sentieon®基因组学工具都具有相同的内置分布式处理能力。这种分布的目标是为了减少流程的总运行时间,以更快地生成结果;然而,这种分布也会带来一些额外的开销,使计算成本增加。 利用分布能力,流程的每个阶段被分成小任务;每个任务处理... 介绍本文档描述了如何利用Sentieon®基因组学工具的分片能力将DNAseq®流程分布到多台服务器上;将其他流程(如TNseq®)进行分布遵循相同原则,因为所有Sentieon®基因组学工具都具有相同的内置分布式处理能力。这种分布的目标是为了减少流程的总运行时间,以更快地生成结果;然而,这种分布也会带来一些额外的开销,使计算成本增加。 利用分布能力,流程的每个阶段被分成小任务;每个任务处理...
- cfDNA的TFx评估和拷贝数分析可以作为评估HCC患者TACE治疗结果的稳健策略。cfDNA中的某些拷贝数扩增会影响脂碘沉积并进一步影响TACE反应,这可用于更好地优化临床决策以指导个性化TACE治疗。 cfDNA的TFx评估和拷贝数分析可以作为评估HCC患者TACE治疗结果的稳健策略。cfDNA中的某些拷贝数扩增会影响脂碘沉积并进一步影响TACE反应,这可用于更好地优化临床决策以指导个性化TACE治疗。
- 从测试结果来看,相同核心数下,Arm架构CPU的运算效率不逊于支持超线程的x86架构CPU,并且倚天CPU的运行时长最短。此外,在高核心数(128)的运算环境下,流程的运行效率也基本没有损失,这点也得到了证实。倚天CPU实例的另一个优势是功耗较低,因此云计算成本也相对较低。 从测试结果来看,相同核心数下,Arm架构CPU的运算效率不逊于支持超线程的x86架构CPU,并且倚天CPU的运行时长最短。此外,在高核心数(128)的运算环境下,流程的运行效率也基本没有损失,这点也得到了证实。倚天CPU实例的另一个优势是功耗较低,因此云计算成本也相对较低。
- 研究者提出的胚系突变整合方法增加了检测到的变体的数量,而对性能没有太大影响。整合方法还允许验证由两种类型的数据识别的变异,并通过将它们分为六组来改善变异的优先级 研究者提出的胚系突变整合方法增加了检测到的变体的数量,而对性能没有太大影响。整合方法还允许验证由两种类型的数据识别的变异,并通过将它们分为六组来改善变异的优先级
- 文献解读-基准与方法研究-第十六期|《GeneMind 公司的 GenoLab M 测序平台 WGS 和 WES 数据基准测试》 文献解读-基准与方法研究-第十六期|《GeneMind 公司的 GenoLab M 测序平台 WGS 和 WES 数据基准测试》
- 该研究通过对不同测序平台测序数据及不同生信分析流程的比较,总结了不同平台的数据特点并分析了相应的原因。 该研究通过对不同测序平台测序数据及不同生信分析流程的比较,总结了不同平台的数据特点并分析了相应的原因。
- 本次真相挑战凸显了在表征临床重要 MHC 位点方面、增加了基因组难比对区域的基准集、首次使用了盲法样本等诸多创新 本次真相挑战凸显了在表征临床重要 MHC 位点方面、增加了基因组难比对区域的基准集、首次使用了盲法样本等诸多创新
- 研究发现德尔塔-奥密克戎重组病毒很少见,且没有证据表明德尔塔-奥密克戎重组病毒与奥密克戎毒株相比具有更高的宿主间传播能力。 研究发现德尔塔-奥密克戎重组病毒很少见,且没有证据表明德尔塔-奥密克戎重组病毒与奥密克戎毒株相比具有更高的宿主间传播能力。
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