- STAR-Fusion是一款基于STAR比对结果进行融合基因鉴定的软件 STAR-Fusion是一款基于STAR比对结果进行融合基因鉴定的软件
- randfold是一个独立的基因测序相关软件,它从原始序列开始随机显示其核苷酸顺序。它根据改组后的序列计算推断结构的最小自由能(MFE),并多次重复计算以建立最小自由能(MFE)值的分布。 randfold是一个独立的基因测序相关软件,它从原始序列开始随机显示其核苷酸顺序。它根据改组后的序列计算推断结构的最小自由能(MFE),并多次重复计算以建立最小自由能(MFE)值的分布。
- BreakDancer是一个C++软件包,可提供下一代配对末端测序读取的全基因组结构变异检测。它包括两个补充程序,BreakDancerMax预测五种类型的结构变异;BreakDancerMini专注于使用正态映射的读取对检测小插入缺失 BreakDancer是一个C++软件包,可提供下一代配对末端测序读取的全基因组结构变异检测。它包括两个补充程序,BreakDancerMax预测五种类型的结构变异;BreakDancerMini专注于使用正态映射的读取对检测小插入缺失
- BCFtools是一组实用程序,以Variant Call Format(VCF)及其二进制副本BCF处理变量调用。 所有命令都可以与未压缩和BGZF压缩的VCF和BCF透明地一起使用。1 安装准备华为云购买一台鲲鹏服务器本文以云服务器KC1实例搭建,云服务器配置如表1-1所示。表1-1 云服务器配置项目说明规格kc1.large.2 | 4vCPUs | 8GB磁盘系统盘:... BCFtools是一组实用程序,以Variant Call Format(VCF)及其二进制副本BCF处理变量调用。 所有命令都可以与未压缩和BGZF压缩的VCF和BCF透明地一起使用。1 安装准备华为云购买一台鲲鹏服务器本文以云服务器KC1实例搭建,云服务器配置如表1-1所示。表1-1 云服务器配置项目说明规格kc1.large.2 | 4vCPUs | 8GB磁盘系统盘:...
- bedtools实用程序是用于处理基因组信息分析的强大工具集合。 例如,bedtools允许人们以广泛使用的基因组文件格式(例如BAM,BED,GFF / GTF,VCF)与多个文件中的基因组间隔相交,合并,计数,互补和混洗。 虽然每个工具都设计为执行相对简单的任务(例如,将两个间隔文件相交),但可以通过在UNIX命令行上组合多个bedtools操作来进行相当复杂的分析。1 安装... bedtools实用程序是用于处理基因组信息分析的强大工具集合。 例如,bedtools允许人们以广泛使用的基因组文件格式(例如BAM,BED,GFF / GTF,VCF)与多个文件中的基因组间隔相交,合并,计数,互补和混洗。 虽然每个工具都设计为执行相对简单的任务(例如,将两个间隔文件相交),但可以通过在UNIX命令行上组合多个bedtools操作来进行相当复杂的分析。1 安装...
- vcftools是一种可以对VCF文件和BCF文件进行格式转换及过滤的工具,其中很多过滤及计算功能可以自己使用perl或者python编写脚本实现,但都不如这个工具的运算速度快。本文档以“vcftools-0.1.16”为例进行说明1 安装准备华为云购买一台鲲鹏服务器本文以云服务器KC1实例搭建,云服务器配置如表1-1所示。表1-1 云服务器配置项目说明规格kc1.large.2... vcftools是一种可以对VCF文件和BCF文件进行格式转换及过滤的工具,其中很多过滤及计算功能可以自己使用perl或者python编写脚本实现,但都不如这个工具的运算速度快。本文档以“vcftools-0.1.16”为例进行说明1 安装准备华为云购买一台鲲鹏服务器本文以云服务器KC1实例搭建,云服务器配置如表1-1所示。表1-1 云服务器配置项目说明规格kc1.large.2...
- 云桌面目前支持瘦终端(TC)和软终端(SC),只要有终端和有网络的地方就可以登录桌面,轻松访问和存取文件以及使用应用,实现移动办公。 云桌面目前支持瘦终端(TC)和软终端(SC),只要有终端和有网络的地方就可以登录桌面,轻松访问和存取文件以及使用应用,实现移动办公。
- Speedseq是一个快速基因组分析和注释的灵活框架,发表在Nature Method(http://www.nature.com/nmeth/journal/vaop/ncurrent/full/nmeth.3505.html)上封装了大量基因组分析的软件,比如比对软件BWA,calling SNP软件freebays,SV鉴定软件lumpy等。 Speedseq是一个快速基因组分析和注释的灵活框架,发表在Nature Method(http://www.nature.com/nmeth/journal/vaop/ncurrent/full/nmeth.3505.html)上封装了大量基因组分析的软件,比如比对软件BWA,calling SNP软件freebays,SV鉴定软件lumpy等。
- Oases是一个转录组组装器,旨在没有任何基因组组装的情况下从短读测序技术生成转录本 Oases是一个转录组组装器,旨在没有任何基因组组装的情况下从短读测序技术生成转录本
- 简要介绍Dlib是一种现代的C++工具包,它包含机器学习算法和用于在C++中创建复杂软件以解决现实世界问题的工具。它广泛应用于工业界和学术界,包括机器人、嵌入式设备、移动电话和大型高性能计算环境。开发语言:C++一句话描述:C++工具包开源协议:建议的版本根据实际需要选择版本,本文档以“Dlib github最新版”为例进行说明。环境要求云服务器要求本文以云服务器KC1实例测试,云服务器配置... 简要介绍Dlib是一种现代的C++工具包,它包含机器学习算法和用于在C++中创建复杂软件以解决现实世界问题的工具。它广泛应用于工业界和学术界,包括机器人、嵌入式设备、移动电话和大型高性能计算环境。开发语言:C++一句话描述:C++工具包开源协议:建议的版本根据实际需要选择版本,本文档以“Dlib github最新版”为例进行说明。环境要求云服务器要求本文以云服务器KC1实例测试,云服务器配置...
- 1 介绍 PennCNV是一个免费软件工具,可从SNP基因分型阵列检测拷贝数变异(CNV)。目前,它可以处理来自Illumina和Affymetrix阵列的信号强度数据。通过适当准备文件格式,它还可以处理其他类型的SNP阵列和寡核苷酸阵列。PennCNV实现了一个隐藏的马尔可夫模型(HMM),该模型集成了多种信息源,以推断单个基因型样本的CNV调用。官网为:http://p... 1 介绍 PennCNV是一个免费软件工具,可从SNP基因分型阵列检测拷贝数变异(CNV)。目前,它可以处理来自Illumina和Affymetrix阵列的信号强度数据。通过适当准备文件格式,它还可以处理其他类型的SNP阵列和寡核苷酸阵列。PennCNV实现了一个隐藏的马尔可夫模型(HMM),该模型集成了多种信息源,以推断单个基因型样本的CNV调用。官网为:http://p...
- 1 介绍 Kaldi是当前最流行的开源语音识别工具(Toolkit),它使用WFST来实现解码算法。Kaldi的主要代码是C++编写,在此之上使用bash和python脚本做了一些工具。 本文档以“Kaldi最新版本”为例进行说明。 2 安装准备 华为云购买一台鲲鹏服务器 本文以云服务器KC1实例搭建,云服务器配置如表1-1所示。 ... 1 介绍 Kaldi是当前最流行的开源语音识别工具(Toolkit),它使用WFST来实现解码算法。Kaldi的主要代码是C++编写,在此之上使用bash和python脚本做了一些工具。 本文档以“Kaldi最新版本”为例进行说明。 2 安装准备 华为云购买一台鲲鹏服务器 本文以云服务器KC1实例搭建,云服务器配置如表1-1所示。 ...
- 云桌面(Workspace)是一种基于云计算的桌面服务。与传统PC和VDI不同,企业无需投入大量的资金和花费数天的部署时间,即可快速构建桌面办公环境。云桌面支持多种登录方式,可让您灵活存取文件及使用应用,实现移动办公。 云桌面(Workspace)是一种基于云计算的桌面服务。与传统PC和VDI不同,企业无需投入大量的资金和花费数天的部署时间,即可快速构建桌面办公环境。云桌面支持多种登录方式,可让您灵活存取文件及使用应用,实现移动办公。
- 近期,博主在备考鲲鹏的HCIA考试,鉴于此,决定把自己在整个课程中学习了解掌握到的相关知识,以博文的方式分享给有需要的朋友! 今天分享的主题是购买云服务器! 本来购买和释放是放在一起的,尝试多次,发博文失败,只能分而发之!还望见谅! 废话就此打住,开始操作实战: 购买云服务器 步骤一: 返回... 近期,博主在备考鲲鹏的HCIA考试,鉴于此,决定把自己在整个课程中学习了解掌握到的相关知识,以博文的方式分享给有需要的朋友! 今天分享的主题是购买云服务器! 本来购买和释放是放在一起的,尝试多次,发博文失败,只能分而发之!还望见谅! 废话就此打住,开始操作实战: 购买云服务器 步骤一: 返回...
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