- 在分析NGS数据(fastq格式)之前,需要有参考基因组,bed文件,输入数据这里构建一个流程,分为两步:将fastq比对为sam,并转成bam(需安装bwa或bowtie,还需安装samtools)对bam的某些区域进行测序深度评估,并绘图(需安装gnuplot)首先用人类hg19的 Exons的bed文件,随机选取某些基因的Exons,作为测试bed。如果用整个bed,运算时间较长。其次... 在分析NGS数据(fastq格式)之前,需要有参考基因组,bed文件,输入数据这里构建一个流程,分为两步:将fastq比对为sam,并转成bam(需安装bwa或bowtie,还需安装samtools)对bam的某些区域进行测序深度评估,并绘图(需安装gnuplot)首先用人类hg19的 Exons的bed文件,随机选取某些基因的Exons,作为测试bed。如果用整个bed,运算时间较长。其次...
- TCGA(The Cancer Genome Atlas)项目完成后,最终和其它的一些肿瘤医学项目一起归档在 GDC Portal网站,方便人们访问。网址是 https://portal.gdc.cancer.gov其中除了TCGA的数据还有其它一些医学项目产生的基因测序数据,以及临床信息数据。网站首页如下:左侧可以点击Projects 根据项目类型,实验类型,基因突变类型搜索样本或数据信... TCGA(The Cancer Genome Atlas)项目完成后,最终和其它的一些肿瘤医学项目一起归档在 GDC Portal网站,方便人们访问。网址是 https://portal.gdc.cancer.gov其中除了TCGA的数据还有其它一些医学项目产生的基因测序数据,以及临床信息数据。网站首页如下:左侧可以点击Projects 根据项目类型,实验类型,基因突变类型搜索样本或数据信...
推荐直播
-
华为开发者空间玩转DeepSeek
2025/03/13 周四 19:00-20:30
马欣 山东商业职业技术学院云计算专业讲师,山东大学、山东建筑大学等多所本科学校学生校外指导老师
同学们,想知道如何利用华为开发者空间部署自己的DeepSeek模型吗?想了解如何用DeepSeek在云主机上探索好玩的应用吗?想探讨如何利用DeepSeek在自己的专有云主机上辅助编程吗?让我们来一场云和AI的盛宴。
即将直播 -
华为云Metastudio×DeepSeek与RAG检索优化分享
2025/03/14 周五 16:00-17:30
大海 华为云学堂技术讲师 Cocl 华为云学堂技术讲师
本次直播将带来DeepSeek数字人解决方案,以及如何使用Embedding与Rerank实现检索优化实践,为开发者与企业提供参考,助力场景落地。
去报名
热门标签