- Alamut-基因变异处理软件方案在NGS分析过程中，前期GATK/BWA、Sentieon等基因变异检测软件获取变异文件后，需要标记每个变异的临床影像，再结合表型探索并寻找致病变异，最终出具相关报告。Alamut软件提供的模块主要负责对变异文件出来后的变异注释、筛选、探索和出具报告的过程。Alamut软件套件分为三个模块：Alamut BATCH、Alamut FOCUS、Alamut V... Alamut-基因变异处理软件方案在NGS分析过程中，前期GATK/BWA、Sentieon等基因变异检测软件获取变异文件后，需要标记每个变异的临床影像，再结合表型探索并寻找致病变异，最终出具相关报告。Alamut软件提供的模块主要负责对变异文件出来后的变异注释、筛选、探索和出具报告的过程。Alamut软件套件分为三个模块：Alamut BATCH、Alamut FOCUS、Alamut V...
- 基因编辑系列文章-1标题（英文）：CRISPR-Mediated Generation and Characterization of a Gaa Homozygous c.1935C>A (p.D645E) Pompe Disease Knock-in Mouse Model Recapitulates Human Infantile Onset-Pompe Disease标题（中文）：通... 基因编辑系列文章-1标题（英文）：CRISPR-Mediated Generation and Characterization of a Gaa Homozygous c.1935C>A (p.D645E) Pompe Disease Knock-in Mouse Model Recapitulates Human Infantile Onset-Pompe Disease标题（中文）：通...
- 介绍本文描述了使用Sentieon® DNAscope进行PacBio® HiFi数据胚系突变检测。PacBio® HiFi技术产⽣质量值超过Q20的高质量长读段，平均长度在10-25kb之间。准确的长读段可以对短读段和高噪音长读段方法无法检测的基因组重复区域进行精准的变异检测。Sentieon® DNAscope能利用PacBio® HiFi数据高质量、长读长的优势，使用经过校准的机器学习... 介绍本文描述了使用Sentieon® DNAscope进行PacBio® HiFi数据胚系突变检测。PacBio® HiFi技术产⽣质量值超过Q20的高质量长读段，平均长度在10-25kb之间。准确的长读段可以对短读段和高噪音长读段方法无法检测的基因组重复区域进行精准的变异检测。Sentieon® DNAscope能利用PacBio® HiFi数据高质量、长读长的优势，使用经过校准的机器学习...
- 流行病学系列文章-1标题（英文）：Rare Variants in Inborn Errors of Immunity Genes Associated With Covid-19 Severity标题（中文）：与Covid-19严重程度相关的免疫基因先天性缺陷的罕见变异发表期刊：《Frontiers in Cellular and Infection Microbiology》作者单位：华... 流行病学系列文章-1标题（英文）：Rare Variants in Inborn Errors of Immunity Genes Associated With Covid-19 Severity标题（中文）：与Covid-19严重程度相关的免疫基因先天性缺陷的罕见变异发表期刊：《Frontiers in Cellular and Infection Microbiology》作者单位：华...
- 背景 Sentieon建议使用jemalloc来改善Sentieon应用程序中的内存管理和整体性能，尤其是Sentieon bwa-mem。有时在安装运行过程中会出现报错： ERROR: ld.so: object '/usr/lib64/libjemalloc.so.2' from LD_PRELOAD cannot be preloaded: ignored. Failed to con... 背景 Sentieon建议使用jemalloc来改善Sentieon应用程序中的内存管理和整体性能，尤其是Sentieon bwa-mem。有时在安装运行过程中会出现报错： ERROR: ld.so: object '/usr/lib64/libjemalloc.so.2' from LD_PRELOAD cannot be preloaded: ignored. Failed to con...
- Sentieon●体细胞变异检测系列-2 Sentieon 致力于解决生物信息数据分析中的速度与准确度瓶颈，通过算法的深度优化和企业级的软件工程，大幅度提升NGS数据处理的效率、准确度和可靠性。 针对体细胞变异检测，Sentieon软件提供两个模块：TNscope和TNhaplotyer2。 TNscope：此模块使用Sentieon特有的算法，拥有更快的计算速度（提速10倍+）和更高的计... Sentieon●体细胞变异检测系列-2 Sentieon 致力于解决生物信息数据分析中的速度与准确度瓶颈，通过算法的深度优化和企业级的软件工程，大幅度提升NGS数据处理的效率、准确度和可靠性。 针对体细胞变异检测，Sentieon软件提供两个模块：TNscope和TNhaplotyer2。 TNscope：此模块使用Sentieon特有的算法，拥有更快的计算速度（提速10倍+）和更高的计...
- 肿瘤基因突变检测是NGS的一个重要应用，其分析难点主要在于低频变异的准确性。不同于遗传病检测，肿瘤样本类型多样，测序方法和参数复杂，且缺乏对应各种场景的公共标准真集。再加上常用开源软件经常遇到的准确性低，稳定性差，速度慢等问题。这使得广大诊断公司在评估肿瘤变异检测工具、搭建高效稳定的生信流程上，面临巨大的挑战。 作为NGS数据二级分析的产品专家，Sentieon推出了一系列肿瘤分析流程，... 肿瘤基因突变检测是NGS的一个重要应用，其分析难点主要在于低频变异的准确性。不同于遗传病检测，肿瘤样本类型多样，测序方法和参数复杂，且缺乏对应各种场景的公共标准真集。再加上常用开源软件经常遇到的准确性低，稳定性差，速度慢等问题。这使得广大诊断公司在评估肿瘤变异检测工具、搭建高效稳定的生信流程上，面临巨大的挑战。 作为NGS数据二级分析的产品专家，Sentieon推出了一系列肿瘤分析流程，...
- Sentieon●体细胞变异检测-系列1 Sentieon 致力于解决生物信息数据分析中的速度与准确度瓶颈，通过算法的深度优化和企业级的软件工程，大幅度提升NGS数据处理的效率、准确度和可靠性。 针对体细胞变异检测，Sentieon软件提供两个模块：TNscope和TNhaplotyer2。 TNscope：此模块使用Sentieon特有的算法，拥有更快的计算速度和更高的计算精度，对临床基因... Sentieon●体细胞变异检测-系列1 Sentieon 致力于解决生物信息数据分析中的速度与准确度瓶颈，通过算法的深度优化和企业级的软件工程，大幅度提升NGS数据处理的效率、准确度和可靠性。 针对体细胞变异检测，Sentieon软件提供两个模块：TNscope和TNhaplotyer2。 TNscope：此模块使用Sentieon特有的算法，拥有更快的计算速度和更高的计算精度，对临床基因...
- 农业系列文章-1标题（英文）：Genomic footprints of sorghum domestication and breeding selection for multiple end uses标题（中文）：高粱驯化的基因组足迹和多种最终用途的育种选择发表期刊：《Molecular Plant》作者单位：中国科学院植物研究所植物资源重点实验室等发表年份：2022文章地址：http... 农业系列文章-1标题（英文）：Genomic footprints of sorghum domestication and breeding selection for multiple end uses标题（中文）：高粱驯化的基因组足迹和多种最终用途的育种选择发表期刊：《Molecular Plant》作者单位：中国科学院植物研究所植物资源重点实验室等发表年份：2022文章地址：http...
- 肿瘤测序系列文章-1标题（英文）：The relationship between genetic characteristics and clinical characteristics and the efficacy of ^131^ I therapy in children and adolescents with locally advanced or metastatic d... 肿瘤测序系列文章-1标题（英文）：The relationship between genetic characteristics and clinical characteristics and the efficacy of ^131^ I therapy in children and adolescents with locally advanced or metastatic d...
- Sentieon | 每周文献-Genetic Disease（遗传病）-第二期 Sentieon | 每周文献-Genetic Disease（遗传病）-第二期
- Sentieon | 每周文献-Population Sequencing-第一期 Sentieon | 每周文献-Population Sequencing-第一期
- 回归和分类模型的评价指标不完全相同。下面是它们的常见评价指标： 回归模型的评价指标： 均方误差（MSE）：所有数据点预测误差的平方和的均值。 均方根误差（RMSE）：均方误差的平方根。 平均绝对误差（MAE）：所有数据点预测误差的绝对值之和的均值。 R平方（$R^2$）：模型拟合数据的程度，范围在0到1之间。$R^2=1$表示模型完美拟合数据，$R^2=0$表示模型无法解释数据。 回归和分类模型的评价指标不完全相同。下面是它们的常见评价指标： 回归模型的评价指标： 均方误差（MSE）：所有数据点预测误差的平方和的均值。 均方根误差（RMSE）：均方误差的平方根。 平均绝对误差（MAE）：所有数据点预测误差的绝对值之和的均值。 R平方（$R^2$）：模型拟合数据的程度，范围在0到1之间。$R^2=1$表示模型完美拟合数据，$R^2=0$表示模型无法解释数据。
- 我们说过分析的最终目的就是为了通过客观的数据去发现公司业务存在的问题，那怎么通过什么数据呢？业务那么多，我到底该用哪些数据啊？这个时候我们就需要找到一个衡量业务好坏的标准了，那这个标准就是我们要说的指标。例如：上文的离职率就是一个反映企业员工稳定性的核心指标；销售额是反映一个销售公司经营情况的核心指标；日活跃用户数是反映一款APP是否受欢迎的核心指标等等。每个行业的常用指标是不同的，这里主要介绍一 我们说过分析的最终目的就是为了通过客观的数据去发现公司业务存在的问题，那怎么通过什么数据呢？业务那么多，我到底该用哪些数据啊？这个时候我们就需要找到一个衡量业务好坏的标准了，那这个标准就是我们要说的指标。例如：上文的离职率就是一个反映企业员工稳定性的核心指标；销售额是反映一个销售公司经营情况的核心指标；日活跃用户数是反映一款APP是否受欢迎的核心指标等等。每个行业的常用指标是不同的，这里主要介绍一
- 目录1、什么是数据透视表2、如何操作3、数据透视表的优势4、适用什么场景5、使用前注意事项1、什么是数据透视表先来举个例子看下面这段对话下午5点30boss：把这张表给我整理成如下格式，就是根据平台给我汇总一下销量和收入，我要做个数据统计同学们，你们接到这样的需求之后，有什么想法呢？哈哈，第一个想法肯定是，我滴妈呀，为啥临到下班点给我派活，一天都干啥去了，是逼我加班么，这是什么boss，真... 目录1、什么是数据透视表2、如何操作3、数据透视表的优势4、适用什么场景5、使用前注意事项1、什么是数据透视表先来举个例子看下面这段对话下午5点30boss：把这张表给我整理成如下格式，就是根据平台给我汇总一下销量和收入，我要做个数据统计同学们，你们接到这样的需求之后，有什么想法呢？哈哈，第一个想法肯定是，我滴妈呀，为啥临到下班点给我派活，一天都干啥去了，是逼我加班么，这是什么boss，真...
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开源，意味着开放、共享、互助、共赢。作为万物上云及各行业数字化的物联网底座，华为云IoT积极拥抱开源，借助行业开源的最佳实践，构建可靠、易用的物联网平台，并通过开放南北向SDK，助力开发者快速构建物联网应用。本期直播，华为云IoT开源专家、物联网平台资深“程序猿”张俭，带你了解华为云IoT的开源生态，并手把手教你玩转开源社区！
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